Neurocentre Magendie



Génotypage

Service ouvert à toute la communauté scientifique


Soyez le prochain...

Pas le temps de génotyper vos souris ?

Les tubes s'accumulent dans le congélateur et les animaux vieillissent ?
Vous avez des souris transgéniques, mais vous n'avez jamais fait de génotypage et vous n'avez pas l'équipement pour le faire ?
Votre technicien ou étudiant passe son temps à faire le génotypage ?

La plateforme est là pour vous ... !

Recevez vos résultats en moins d'une semaine.



Nous proposons un grand nombre de protocoles universels (cre, creERT2, GFP, YFP, Neo, Sexage, LacZ, ...), mais nous proposons de réaliser vos génotypages spécifiques (loxp, KO, KI, mutation, recombinaison, ...). Nous avons une grande expérience dans le multiplexage, permettant de révéler les doubles ou triples transgéniques en une seule PCR (Cre-Lox). Notre expertise, nos méthodes diverses et adaptées vous assurent des résultats de qualité quels que soient vos échantillons ou vos lignées.



Les prestations proposées

Pensez-y pour vos Cre-Lox !
Nous vérifions la recombinaison dans vos tissus spécifiques par PCR


Mise au point et validation des protocoles de génotypage

Si votre protocole ne fonctionne pas bien, si vous n'êtes pas satisfait de la stratégie, nous proposons de mettre au point une nouvelle stratégie, au travers de design d'amorces, ou d'améliorer les conditions afin d'obtenir un résultat fiable. Nous dessinons également des amorces pour vérifier les recombinaisons des Cre-Lox


Extraction d'ADN génomique

Nos extractions sont réalisées en automatique sur le robot Zephyr avec le kit Macherey-Nagel utilisant la technologie des colonnes de silice. Nous pouvons aussi traiter vos échantillons en punch FTA, ou bien réaliser une lyse NaOH


PCR universelle ou spécifique

Les PCR peuvent être spécifiques du transgène recherché ou universelles. Autant que possible nous multiplexons les PCR afin de rechercher plusieurs gènes dans une même PCR.
Liste des PCR universelles proposées : GFP, Néomycine, Cre, LacZ, Tta, Tomato, Luciferase, Sexage


Analyse en électrophorèse capillaire automatique

Les électrophorèses sont automatisées grâce au Labchip GX. La haute résolution de l'électrophérogramme obtenu a permis d'améliorer la lecture des résultats, et de multiplexer un grand nombre de protocoles.


Interprétation et rendu des résultats

Etape cruciale, où l'oeil expert de nos techniciens valide et interprète les résultats. Les résultats sont saisis un à un et le génotype de chaque animal est consultable directement dans ANISE, ou transmis par mail via le formulaire qui accompagne vos échantillons.




Les tarifs   PDF


La procédure d'envoi

1-Remplissez le formulaire Excel

Télécharger le formulaire Excel
Envoyer le formulaire au service

2-Identifiez vos tubes

Notez lignée + n° sur chaque tube
Utilisez des tubes de 1.5ml de préférence

3-Envoyez vos échantillons

Soit par dépôt direct à la plateforme => Accès
Soit par courrier postal (Sous enveloppe à bulle à t° ambiante) à l'adresse suivante :

Neurocentre Magendie
Service Genotypage
146 Rue Leo saignat
33077 Bordeaux


Gestion de colonies transgéniques

Service réservé au Neurocentre


Aujourd'hui le neurocentre Magendie compte plus de 150 lignées de souris transgéniques qu'il est nécessaire de produire et d'entretenir au quotidien. La plateforme assure alors :

La planification de la production d'animaux en fonction des besoins de chaque projet
Le suivi de la production et l'entretien des lignées
la mise à jour du Logiciel de gestion d'animaux ANISE

ANISE

Cette base de données répertorie l'ensemble des caractéristiques de chaque individu (lignée, identification, sexe, àge, origine, date de naissance) mais aussi les informations relatives à la production (accouplements, naissances). L'interface permet à chacun d'analyser rapidement le nombre d'animaux disponibles de chaque colonie, de consulter l'état de la production, et de réserver des animaux, demander des accouplements, ou des sorties en expérimentation. Ce logiciel permet également de se créer facilement son catalogue de lignée avec des liens vers les bases de données comme MGI ou Jackson.

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Import-Export

Service réservé au Neurocentre


De nombreuses collaborations s'articulent autour des animaux et la plateforme assure :

L'organisation et la gestion des formalités dans l'import/export des nouvelles lignées
Le suivi de projet de re-dérivation
L'organisation des transports d'animaux

Nous organisons plus d'une dizaine de transport par an vers de nombreuses destinations en France, mais aussi en Italie, Suisse, USA, Allemagne, Espagne....;Et comptons en moyenne plus de 5 nouvelles importations chaque année.