Neurocentre Magendie


ANISE


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Fonctionnalités:

Inventorier les animaux transgéniques hébergés et produits à l'animalerie
Gérer les croisements (suivi des accouplements et des naissances, génotypage des animaux, suivi généalogique, demande d'euthanasie)
Gérer la réservation des animaux en ligne, la demande de sortie en expérimentation par les utilisateurs des équipes
Générer automatiquement le registre des entrées et sorties des animaux et donc assurer le suivi et la tra├žabilité des animaux à tout instant


GEASE


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Fonctionnalités:

GEASE (Gene Expression Analysis Software Environment) est une application serveur base de données pour le stockage, la gestion et l'analyse à haut débit des données transcriptomiques (biopuces Microarray, qPCR) :
Stockage des données biologiques
Gestion et suivi des échantillons (LIMS)
Traitement des données de qPCR (représentation graphique des plans de plaques), normalisation et comparaison (fold change)
Integration des relations inter espèce (Orthologues basés sur la base de données NCBI HomoloGene)
Construction intéractive de requêtes complexes modulant les cut-offs pour plusieurs paramètres (log ratio, détection et pvalue de variation) et combinant des critères avec des opérateurs logiques
Script d'annotation qui met à jour quotidiennement les identifiants des gènes (nom de gène, location chromosomique, ontologie, ...) à partir des banques NCBI


Modules Intranet


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Fonctionnalités:

Base de données du personnel
Fiches Hygiène et Sécurité
Alimentation semi-automatisée de la base de données bibliographique du Neurocentre
Demandes et validations des congés
Déclaration des travailleurs isolés/horaires décalés
Réservation des salles et matériels
Gestion des magasins et commandes
Facturation des plateformes
...



Programmes à façon


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Exemples:

Macros Excel (Visual Basic), Réalisation de tableaux statistiques et de graphes à partir de données brutes
Electrophysiologie (Spike2), Détection de spikes/bursts, et calcul de statistiques
Macros et Plugins ImageJ, analyse de fichier images, détection des noyaux/cellules, mesure et extraction d'images